По окончании прохождения курса слушатель будет знать:
- Основы программирования на Python 3;
- Библиотеки Python для анализа данных;
- Основы работы в ОС Linux;
- Статистические методы анализа биологических данных;
- Теоретические и прикладные основы анализа больших данных;
- Биоинформатический анализ геномных данных;
- Методы цифрового фенотипирования;
- Принципы работы с биологическими базами данных;
- Основы молекулярной диагностики и генетики;
- Правила оформления и представления результатов.
По окончании прохождения курса слушатель будет уметь:
- Программировать на Python и R;
- Работать с командной строкой и ОС Linux;
- Проводить статистический анализ биологических данных;
- Анализировать большие данные;
- Выполнять биоинформатический анализ геномных данных;
- Подбирать праймеры и проводить виртуальную ПЦР;
- Применять методы цифрового фенотипирования;
- Использовать биоинформатические базы данных;
- Проводить геномную и маркер-ориентированную селекцию;
- Интегрировать геномные и фенотипические данные;
- Создавать и управлять базами данных;
- Оформлять и защищать результаты проектной деятельности.
Содержание курса:
Модуль 1. Биоинформатический анализ геномных данных: методы, статистика и практика
Тема 1.1. Основы работы с ОС Linux
Тема 1.2. Статистический анализ биологических данных
Тема 1.3. Цифровые технологии в обработке данных
Модуль 2. Цифровые инструменты для генотипирования и фенотипирования
Тема 2.1. Основы языка программирования Python
Тема 2.2. Анализ биологических последовательностей программными инструментами
Тема 2.3. Цифровое фенотипирование
Модуль 3. Стажировка
Итоговая аттестация в форме демонстрационного экзамена (защиты итогового проекта)
Преподаватели
Кандидат биологических наук, доцент кафедры защиты растений, экологии и химии, научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований и селекции растений института аграрной генетики и селекции ФГБОУ «Ставропольского государственного аграрного университета», заведующая лабораторией ПЦР-диагностики НПЦ Агробиотехнологии, г. Ставрополь
Ирина Ковалева
Кураторы курса
E-mail
