По окончании прохождения курса слушатель будет знать:
- Природу биологических данных и их особенности;
- Базовые описательные статистики;
- Базовую структурную иерархию генома;
- Концепцию мозаичного строения эукариотических генов;
- Принципы NGS и ограничения метода;
- Физический и химический принцип фрагментного анализа;
- Ключевые параметры эксперимента.
По окончании прохождения курса слушатель будет уметь:
- Работать в терминале Linux, выполнять основные операции с файлами, каталогами и данными в командной строке;
- Применять базовые методы описательной статистики для анализа биологических данных;
- Использовать Excel и надстройку «Анализ данных» для расчета основных статистических показателей;
- Понимать организацию геномов эукариот и использовать эти знания при решении прикладных задач;
- Ориентироваться в принципах NGS-секвенирования и этапах анализа NGS-данных;
- Интерпретировать результаты фрагментного анализа.
Содержание курса:
Тема 1. Терминал Linux. Основные Linux-команды.
Тема 2. Статистический анализ биологических данных.
Тема 3. Расчет основных статистических показателей с использованием надстройки Анализ данных в программе Excel.
Тема 4. Организация геномов эукариот
Тема 5. Анализ данных NGS-секвенирования. NGS-секвенирование.
Тема 6. Фрагментный анализ.
Итоговая аттестация (Зачет)
Преподаватели
Кандидат биологических наук, доцент кафедры защиты растений, экологии и химии, научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований и селекции растений института аграрной генетики и селекции ФГБОУ «Ставропольского государственного аграрного университета», заведующая лабораторией ПЦР-диагностики НПЦ Агробиотехнологии, г. Ставрополь
Ирина Ковалева
Кураторы курса
E-mail